More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3646 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  84.04 
 
 		 470 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  933    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  43.04 
 
 		 466 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 462 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  39.31 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  40.13 
 
 		 462 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  40.04 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 521 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  38.95 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  41.91 
 
 		 463 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  41.1 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  40.87 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 463 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  40 
 
 		 465 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  36.5 
 
 		 466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  39.46 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 476 aa  226  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 465 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  32.26 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  33.77 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 472 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  32.57 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 474 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 472 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.47 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.04 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 475 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 468 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 436 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 436 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.83 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  30.52 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 419 aa  150  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  32.16 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.65 
 
 		 427 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.4 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  32.69 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  29.77 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>