More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0889 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 487 aa  956    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  52.61 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  50.65 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  52.37 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  51.3 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  49.22 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  47.61 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  37.82 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  36.9 
 
 		 465 aa  326  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.77 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 463 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.03 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  31.46 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.94 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  30.74 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 464 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 473 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.93 
 
 		 438 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 469 aa  144  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.25 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.94 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.77 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 430 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  33.07 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 425 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.55 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.77 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  29.27 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  30.88 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  31.4 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  32.35 
 
 		 449 aa  136  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 472 aa  136  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.5 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.54 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.39 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.26 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 435 aa  133  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.09 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  29.4 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>