More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2058 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  965    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  71.64 
 
 		 482 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  67.66 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  61.83 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  62.31 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  60.9 
 
 		 473 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  57.94 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  55.87 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  55.87 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  55.87 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  58.21 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  54.18 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  53.75 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  53.56 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  54.43 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  49.1 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  48.87 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  45.47 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  48.5 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  40.13 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  39.47 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 		 468 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 475 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 491 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 		 491 aa  246  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  36.36 
 
 		 489 aa  236  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  37.34 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.92 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.59 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  30.04 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  32.59 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.73 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 521 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 496 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 443 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.8 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 464 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.75 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.72 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28.95 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  33.41 
 
 		 470 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.41 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 472 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.93 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.8 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.05 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.47 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  32.64 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 487 aa  130  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  27.93 
 
 		 435 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 424 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  28.92 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>