More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
459 aa  936    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
464 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  63.97 
 
 
464 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  64.19 
 
 
464 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  62.01 
 
 
473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 
468 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  59.01 
 
 
443 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 
468 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  58.42 
 
 
480 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  57.27 
 
 
477 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  55.19 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  55.85 
 
 
471 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 
487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  45.3 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 
457 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 
463 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  38.11 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  40.44 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
483 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
466 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
454 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
462 aa  202  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 
466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.62 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  33.33 
 
 
466 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
456 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
456 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
465 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
456 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
460 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  33.11 
 
 
465 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
460 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 
462 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
457 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
473 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
462 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  32.67 
 
 
463 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
460 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
460 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
472 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  32.56 
 
 
460 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
460 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  32.26 
 
 
463 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
463 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.46 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
491 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
463 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
486 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
463 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
425 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
430 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
491 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.41 
 
 
439 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 
423 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
468 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.02 
 
 
439 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.17 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  28.95 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
430 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
465 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
425 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
482 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
444 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
443 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
465 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
469 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
521 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
462 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  29.89 
 
 
466 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.33 
 
 
426 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
426 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
437 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.33 
 
 
426 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.33 
 
 
426 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.16 
 
 
462 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
425 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.42 
 
 
424 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
462 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
494 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
491 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
435 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.1 
 
 
426 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
426 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
475 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.1 
 
 
426 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
435 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
435 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
466 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  28.63 
 
 
480 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 
482 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
424 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>