More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3367 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  95.78 
 
 		 463 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  96.22 
 
 		 463 aa  884    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  80 
 
 		 465 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  100 
 
 		 463 aa  935    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  78.89 
 
 		 463 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  93.78 
 
 		 463 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  81.25 
 
 		 465 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  65.15 
 
 		 491 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  68.36 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 		 521 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  65.15 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  64.79 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  63.5 
 
 		 462 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  64.29 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  64 
 
 		 462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  55.12 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  53.81 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  45.09 
 
 		 466 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 		 486 aa  333  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  42.02 
 
 		 470 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  41.65 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 496 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.54 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  35.19 
 
 		 466 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 476 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.11 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  33.49 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  34.51 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.23 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  34.66 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 480 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.99 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.04 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 431 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.36 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.36 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.36 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.36 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.36 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.11 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.8 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.08 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.45 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  34.91 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 		 487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 468 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>