More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2784 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  69.93 
 
 
463 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
483 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  90.5 
 
 
486 aa  889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  50.88 
 
 
465 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
464 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  39.78 
 
 
464 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 
464 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  40.67 
 
 
473 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 
487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
459 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  38.87 
 
 
480 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  38.36 
 
 
470 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  39.83 
 
 
468 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  39.83 
 
 
468 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
477 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
471 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
457 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
477 aa  266  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
496 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  30.45 
 
 
465 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  30.75 
 
 
465 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
463 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  29.22 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
462 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
521 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  31.24 
 
 
463 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
435 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
491 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
444 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  31.03 
 
 
435 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
457 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
466 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
425 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  29.68 
 
 
462 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  29.22 
 
 
462 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
444 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  29.35 
 
 
463 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
425 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
435 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
435 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 
473 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
456 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
456 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
425 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
435 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
435 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
465 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
453 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
453 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
460 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
456 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.94 
 
 
460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
473 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.11 
 
 
437 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
463 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
460 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
425 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.6 
 
 
439 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
435 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
482 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
435 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
468 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
436 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
474 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
437 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
435 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
437 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  28.8 
 
 
463 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
464 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
429 aa  153  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
466 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
472 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  27.69 
 
 
482 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  30.18 
 
 
466 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.61 
 
 
438 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
429 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
431 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  32.64 
 
 
429 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
429 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
427 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
469 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
439 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
424 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
425 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
454 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
427 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  29.53 
 
 
470 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
430 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
435 aa  150  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>