More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1515 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
463 aa  948    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  71.52 
 
 
486 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  69.93 
 
 
483 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  47.08 
 
 
465 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
480 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  41.01 
 
 
464 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 
459 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  41.78 
 
 
473 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
468 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
468 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  38.34 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 
487 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
471 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
477 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 
457 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.08 
 
 
465 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  31.64 
 
 
465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
466 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
462 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
463 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  28.67 
 
 
462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.8 
 
 
439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  31.34 
 
 
463 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.07 
 
 
439 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  29.64 
 
 
463 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
463 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 
444 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
462 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
463 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
425 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
521 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
462 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  29.68 
 
 
463 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
425 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
457 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
444 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
462 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
430 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
444 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  28.67 
 
 
462 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
435 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
437 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.9 
 
 
438 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
456 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
430 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  27.99 
 
 
462 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
491 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
456 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
474 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
473 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
456 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
460 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
427 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
425 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
437 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
436 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
469 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
424 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
437 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
460 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  28.99 
 
 
424 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
453 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  30.07 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.31 
 
 
460 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
429 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.69 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.19 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
425 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
454 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
428 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 
427 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
465 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
428 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
431 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  29.64 
 
 
435 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
435 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
428 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
427 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
431 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
460 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
428 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
427 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>