More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0780 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
469 aa  953    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
468 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  45.02 
 
 
476 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  45.52 
 
 
468 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  45.02 
 
 
468 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 
468 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  44.84 
 
 
468 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
475 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 
475 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
491 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
491 aa  345  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 
491 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  39.82 
 
 
489 aa  319  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  43.89 
 
 
466 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  40.42 
 
 
493 aa  292  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 
463 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
472 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  40.49 
 
 
460 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 
460 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
465 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
473 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
462 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 
460 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 
460 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  38.11 
 
 
460 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  37.96 
 
 
466 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 
460 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
457 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  36.91 
 
 
480 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
454 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 
472 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 
482 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
464 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
462 aa  227  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
456 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
428 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  31.38 
 
 
473 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
453 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  26.15 
 
 
465 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
459 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
464 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
480 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
427 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
472 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  27.9 
 
 
470 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
473 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.1 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
443 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
468 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
468 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
463 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
496 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
483 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
425 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
434 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
464 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  29.8 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  30.32 
 
 
463 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.17 
 
 
427 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
429 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
443 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
425 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  30.41 
 
 
465 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
487 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.68 
 
 
427 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
424 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.19 
 
 
462 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
426 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  30.48 
 
 
470 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
453 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
463 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.83 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30.39 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  30.21 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
424 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  30.19 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  29.68 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
428 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  29.63 
 
 
435 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  33.25 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
435 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.74 
 
 
430 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
428 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>