More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1987 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  75.27 
 
 		 466 aa  698    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 465 aa  926    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  63.46 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 473 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  62.31 
 
 		 480 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  58.85 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  60.35 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  61.05 
 
 		 460 aa  505  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  60.14 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  59.91 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  59.45 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  48.67 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  46.63 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  46.93 
 
 		 462 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  44.91 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  43.52 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  43.31 
 
 		 468 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  40.13 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  39.7 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 468 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 491 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 491 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 464 aa  277  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  40.28 
 
 		 489 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  39.82 
 
 		 493 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.83 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.94 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.17 
 
 		 473 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 473 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.49 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.33 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 491 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 496 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.1 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.74 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.94 
 
 		 465 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29 
 
 		 470 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.81 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  32.04 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  31.98 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  34.46 
 
 		 466 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 462 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.6 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 425 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  28.51 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 466 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  29.31 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 486 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  33.8 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  29.9 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.61 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>