More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3678 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1004    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  83.1 
 
 		 491 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  83.3 
 
 		 491 aa  807    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  82.89 
 
 		 491 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  51.66 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  48.55 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  47.84 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  47.86 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  47.65 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  45.81 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  45.81 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  45.6 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  45.4 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 466 aa  309  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  42.92 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 462 aa  286  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  37.06 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 457 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  36.23 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 472 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  35.21 
 
 		 460 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 466 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 462 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 460 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.03 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.64 
 
 		 470 aa  179  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.44 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.41 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 443 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 483 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  30.68 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.5 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  30.68 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.16 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  30.02 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  29.83 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.36 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 521 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.79 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  29.79 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 427 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.97 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.69 
 
 		 427 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 462 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 427 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  30.46 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 425 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.43 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.43 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  29.43 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.43 
 
 		 426 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  29.43 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>