More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6399 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  73.66 
 
 		 453 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  68.51 
 
 		 482 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 482 aa  988    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  73.66 
 
 		 453 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  67.82 
 
 		 455 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  65.91 
 
 		 494 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  65.14 
 
 		 465 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  65.84 
 
 		 494 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  65.84 
 
 		 494 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  61.22 
 
 		 455 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2895  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  30.89 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.84 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.83 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.99 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.98 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  32.61 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.14 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.59 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.51 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.67 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 427 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.45 
 
 		 427 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.45 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.22 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 427 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 463 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.33 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  30.9 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30.25 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  31.48 
 
 		 430 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  29.45 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.41 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.46 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.21 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>