More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6396 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  74.72 
 
 		 494 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 482 aa  987    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  70.85 
 
 		 482 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  72.17 
 
 		 465 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  73.59 
 
 		 494 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  74.72 
 
 		 494 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  69.61 
 
 		 455 aa  624  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  64.14 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  64.14 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  61.31 
 
 		 455 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2895  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  35.01 
 
 		 428 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 428 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 428 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  33.5 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 428 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.81 
 
 		 427 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.99 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.13 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.99 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 428 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 423 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.41 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.01 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.27 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.01 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.6 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.16 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 427 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 425 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.62 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.12 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.12 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  30.02 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  31.61 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 435 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.99 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  29.82 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 459 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 460 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.67 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>