More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3223 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 465 aa  936    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  69.33 
 
 		 465 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  69.25 
 
 		 465 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  69.04 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  68.82 
 
 		 463 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  68.37 
 
 		 463 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  68.6 
 
 		 463 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  65.03 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  64.29 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  63.85 
 
 		 491 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  64.29 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  64.29 
 
 		 521 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  63.34 
 
 		 462 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  63.25 
 
 		 462 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  60.74 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  54.53 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  53.45 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  42.55 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  39.51 
 
 		 470 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 476 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  39.67 
 
 		 469 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  31.84 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 464 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 472 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.96 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.58 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 464 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 427 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.81 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  27.35 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  32.48 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  32.84 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 487 aa  143  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 437 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  28.61 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.28 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  27.13 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 429 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  32.19 
 
 		 468 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.76 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.76 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.76 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.76 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>