More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3091 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
381 aa  770    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 
381 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
404 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1969  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.053713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0359  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
382 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 
428 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
429 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
434 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
425 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
472 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  28.89 
 
 
430 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
429 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  28.64 
 
 
430 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
435 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
429 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  27.59 
 
 
424 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  28.64 
 
 
430 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
436 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
441 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
427 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
430 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  28.01 
 
 
430 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  26.27 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
429 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  28.16 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
430 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  29.03 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
429 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
429 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
428 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
428 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  25.12 
 
 
437 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
437 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
429 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
429 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
428 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  26.52 
 
 
430 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
428 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
433 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.16 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  26.38 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
428 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
444 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  27.99 
 
 
426 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 
433 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
435 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
425 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
433 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
425 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  28.22 
 
 
461 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
429 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
444 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
424 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  28.25 
 
 
449 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
433 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
435 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
424 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
433 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02230  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_8G05850)  25.25 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000761243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  26.29 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>