More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3550 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 415 aa  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  80.96 
 
 		 415 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  29.85 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30.5 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.17 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  26.77 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  26.77 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  28 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 444 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 444 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 444 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  26.85 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.98 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.48 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  28.14 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  28.14 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.14 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.89 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  26.78 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.64 
 
 		 426 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.48 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  27.97 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  27.43 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  24.94 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  26.88 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  26.11 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>