More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1338 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 415 aa  829    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  80.96 
 
 		 415 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 381 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.23 
 
 		 424 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  29.65 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 424 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 424 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  27.59 
 
 		 428 aa  126  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 427 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  27.59 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.11 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  28.22 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 431 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.47 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.43 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  27.11 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  27.68 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  26.2 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  27.56 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  27.93 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.93 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.93 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 463 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.68 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 435 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.68 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 435 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 435 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.75 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.86 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  28.71 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  29.58 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  27.75 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 427 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>