More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4199 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  97.03 
 
 		 437 aa  877    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  904    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  60.09 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  43.35 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  39.13 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  40.27 
 
 		 438 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 439 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  38.95 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  36.69 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 448 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  29.91 
 
 		 448 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 448 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  31.15 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  28.34 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  27.76 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 482 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 422 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 521 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  27.42 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  26.81 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  26.76 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  27.23 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  28.68 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 496 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  27.23 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 444 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  26.37 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  25.59 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  24.64 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  24.57 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  28.75 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 444 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  26.98 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.44 
 
 		 431 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  29.52 
 
 		 473 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  25.59 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  25.82 
 
 		 465 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  25.59 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  24.6 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.81 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  27.82 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  28.93 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  27.05 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  28.93 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>