More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2297 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
446 aa  915    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  60.09 
 
 
437 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  59.63 
 
 
437 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  47.6 
 
 
439 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  38.53 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
439 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
439 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  35.88 
 
 
439 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  38.85 
 
 
442 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
439 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
443 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  34.81 
 
 
387 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
448 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
448 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
448 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
448 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  30.43 
 
 
448 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
430 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  30.16 
 
 
448 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  30.98 
 
 
446 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
447 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 
482 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
465 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
425 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
494 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.73 
 
 
473 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
468 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
468 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.31 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
459 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
482 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
429 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  27.4 
 
 
462 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
425 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.38 
 
 
464 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
468 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
433 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
468 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
477 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  29.34 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  29.56 
 
 
468 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
425 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  28.1 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  27.32 
 
 
462 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  27.71 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
424 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
483 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  29.46 
 
 
489 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
425 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  26.13 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
428 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
428 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  25.18 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
463 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
491 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  26.13 
 
 
427 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
434 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.75 
 
 
455 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
486 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  26.71 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  31.22 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>