More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4482 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  904    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  97.03 
 
 		 437 aa  877    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  59.63 
 
 		 446 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 439 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  38.67 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 439 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  40.05 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  39.18 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  36.69 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 443 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 439 aa  246  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 448 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  31.38 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  29.91 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  28.12 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  26.19 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  26.53 
 
 		 465 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  27.42 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  26.57 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  27.3 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  27.3 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 425 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  24.42 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 491 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 431 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  25.35 
 
 		 462 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  28.42 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  29.05 
 
 		 473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.62 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  27.87 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  26.98 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  25.12 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  25.82 
 
 		 465 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  25.12 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  24.08 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 427 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  24.11 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  27.05 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  28.95 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  28.46 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  24.41 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  28.5 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>