More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5757 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  80.59 
 
 		 443 aa  745    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 443 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  41.42 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  42.82 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  34.55 
 
 		 438 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  34.09 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  36.4 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 447 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  33.71 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 437 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  34.93 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.04 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.04 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.04 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.04 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.04 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.79 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.17 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  28.75 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  30.34 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  27.95 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  28.99 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  24.3 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 480 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.29 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  28.26 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 427 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  28.21 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  28.21 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  27.96 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  29 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  27.96 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 482 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  28.53 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  31.31 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.32 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>