More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5122 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 460 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 453 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6312  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  28.63 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  29.9 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  29.9 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.5 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.64 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.43 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  30.9 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.9 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  28.47 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  27.78 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  27.38 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 424 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 435 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 430 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.06 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  28.26 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 491 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  28.5 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  32.53 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  30.81 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.02 
 
 		 473 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 486 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 437 aa  136  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  25.07 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  29.21 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  26.37 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>