More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6312 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6312  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 448 aa  899    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  28.69 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  29.87 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  29.21 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.41 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 426 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  28 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 444 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.66 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.75 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  27.46 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  27.71 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 479 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 462 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 469 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  27.93 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 473 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  28.04 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.05 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 472 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  28.27 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  24.01 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  29.28 
 
 		 435 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  26.79 
 
 		 462 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.7 
 
 		 473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  29.61 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 482 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  28.23 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  27.95 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.95 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.95 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  27.42 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.71 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>