231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1837 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 381 aa  770    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  41.82 
 
 		 375 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  41.02 
 
 		 375 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 384 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  37.57 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  36.44 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.46 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.41 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.03 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.04 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.03 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.04 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.04 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.04 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.03 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 815 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.93 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  26.97 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.93 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  23.38 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  22.51 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 806 aa  63.2  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 825 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  22.59 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 823 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  27.37 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>