More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1627 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  99.47 
 
 		 375 aa  742    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  74.6 
 
 		 379 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 		 378 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  61.02 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 		 378 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  63.03 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  61.07 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  56.33 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  54.81 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  55.26 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  51.47 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  50.4 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  50.27 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  53.83 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  42.43 
 
 		 368 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 367 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.35 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  40.54 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 376 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 369 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  28.89 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  28.89 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  24.44 
 
 		 476 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  26.21 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.29 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 805 aa  69.7  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 418 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.33 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.71 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 806 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.86 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.92 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.9 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.65 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.22 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 394 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 802 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  26.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  28.18 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  25.51 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  25.51 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 817 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  22.42 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.02 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>