More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0708 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 362 aa  747    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  40.71 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  40.7 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 		 376 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 366 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 369 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.34 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.34 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.34 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.34 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.34 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 370 aa  255  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  38.16 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  40.22 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  40.27 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 374 aa  235  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  39.46 
 
 		 368 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  38.3 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  38.19 
 
 		 371 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  38.3 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  36.49 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 370 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  32.8 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  34.85 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 		 447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 496 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  28.89 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.66 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.03 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.41 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  27.68 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  27.5 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 409 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  28.64 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  28.32 
 
 		 404 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  29.76 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  28.43 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  28.46 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  29.51 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 500 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  26.14 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 442 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  28.07 
 
 		 625 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.87 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  27.57 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.79 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  28.27 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.68 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  26.02 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  28.17 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  26.02 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  27.96 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>