More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4669 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  42.63 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  42.25 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  42.36 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  43.3 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  42.36 
 
 		 378 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  40.64 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  40.34 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  40.11 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 375 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 823 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.03 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.42 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 815 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 816 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 806 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 816 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 806 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 815 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.58 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 802 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  28.57 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.38 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.34 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.34 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 821 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.92 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.55 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 819 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.12 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>