More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0434 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 382 aa  753    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  35.25 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 375 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  33.14 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 816 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.73 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 815 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 815 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 817 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  30 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 815 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  32.41 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 823 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 819 aa  86.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 805 aa  86.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  26.44 
 
 		 831 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 799 aa  83.2  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 816 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 806 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 827 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 831 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 812 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 835 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 802 aa  73.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 826 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 837 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.61 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 827 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 482 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>