More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1429 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 383 aa  757    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  45.7 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  48.67 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 375 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  43.01 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  42.78 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  47.2 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  43.7 
 
 		 375 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  43.7 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  46.48 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  45.79 
 
 		 400 aa  252  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  43.45 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  40.7 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  41.45 
 
 		 368 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.74 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 385 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 806 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.33 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 806 aa  96.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 802 aa  96.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 806 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.88 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 804 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.92 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.32 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.96 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.96 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.92 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.92 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.92 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 801 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 805 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.79 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 479 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 823 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.29 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 812 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  26.06 
 
 		 879 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.63 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>