More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08100 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
503 aa  1025    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  45.51 
 
 
485 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
496 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  45.79 
 
 
489 aa  411  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  43.99 
 
 
476 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  44.15 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.79 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 
478 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 
479 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 
494 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
478 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  42.49 
 
 
473 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 
484 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
480 aa  359  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 
479 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 
491 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
493 aa  347  3e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  38.05 
 
 
511 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 
473 aa  339  7e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 
576 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 
965 aa  320  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 
475 aa  319  7e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  40 
 
 
508 aa  311  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  35.01 
 
 
472 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
461 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
470 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
465 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 
473 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 
473 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
464 aa  239  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.74 
 
 
464 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
465 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  30.81 
 
 
396 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  31.5 
 
 
387 aa  176  8e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  35.54 
 
 
698 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 
373 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
366 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
409 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.27 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.27 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.27 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.27 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
362 aa  148  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 
373 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32 
 
 
373 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
368 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 
368 aa  143  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  26.57 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
369 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  29.59 
 
 
368 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
374 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
400 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
369 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
369 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
369 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
369 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
367 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
412 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
366 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.37 
 
 
366 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
369 aa  133  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
371 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.66 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.3 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  26.12 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
367 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
367 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
375 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
370 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  25.99 
 
 
572 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  26.33 
 
 
552 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  29.32 
 
 
368 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.1 
 
 
403 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  27.09 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
364 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
363 aa  117  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.32 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.32 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  26.95 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  26.09 
 
 
585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  25.07 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>