250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4257 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 363 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  71.2 
 
 		 368 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  73.37 
 
 		 368 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  55.74 
 
 		 370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  52.03 
 
 		 368 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  54.22 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  52.45 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.7 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.7 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.7 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  53.7 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.7 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.42 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  53.42 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  53.42 
 
 		 368 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.6 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  52.03 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  53.68 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  53.13 
 
 		 369 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  53.02 
 
 		 368 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 		 369 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 		 369 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 		 369 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  53.42 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  52.75 
 
 		 364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  53.3 
 
 		 366 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  52.88 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  52.07 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  51.78 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.59 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  53.12 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  47.53 
 
 		 367 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  51.31 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  47.7 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  47.96 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  50.15 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  49.71 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  49.41 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  48.77 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 378 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 		 364 aa  289  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  48.76 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  48.92 
 
 		 376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  46.96 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  43.08 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  44.2 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 369 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  39.05 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  36.28 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  37.57 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  31.69 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  29.78 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  30.27 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  31.82 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  29.21 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.05 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 403 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.2 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  29.06 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  30.79 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  30.85 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  31.03 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 407 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  32.48 
 
 		 407 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  28.82 
 
 		 410 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  28.57 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  27.66 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  27.66 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  27.66 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  27.96 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  27.96 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>