More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1023 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  98.34 
 
 		 422 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 422 aa  875    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  87.91 
 
 		 422 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  98.34 
 
 		 422 aa  863    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  98.1 
 
 		 422 aa  862    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  88.15 
 
 		 422 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  97.39 
 
 		 422 aa  840    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  88.15 
 
 		 422 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  98.1 
 
 		 422 aa  862    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  98.58 
 
 		 422 aa  866    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  98.58 
 
 		 422 aa  866    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  87.44 
 
 		 422 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  88.39 
 
 		 422 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  98.1 
 
 		 422 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  71.78 
 
 		 416 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  72.02 
 
 		 416 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  72.02 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  72.08 
 
 		 425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  57.14 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  59.65 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  57.97 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  58.33 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  55.94 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  56.19 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  55.87 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  54.06 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  54.34 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  51.4 
 
 		 397 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  53.44 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  53.2 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  52.42 
 
 		 403 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  52.04 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  52.17 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  52.17 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  53.18 
 
 		 410 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  50.38 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  47.73 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  47.73 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 400 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  47.07 
 
 		 407 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  46.82 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  46.98 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.38 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 400 aa  358  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  43.89 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.03 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.72 
 
 		 396 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  40.77 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 395 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  42.59 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  39.28 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  43.3 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 442 aa  302  8.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  40.31 
 
 		 625 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  41.41 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  38.85 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  40.11 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  38.23 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  56.02 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  38.69 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.08 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 406 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 405 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.2 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 371 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.3 
 
 		 366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  31.71 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  30 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.1 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.1 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.1 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.1 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  26.73 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.82 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>