More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4647 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 366 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  82.47 
 
 		 368 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  83.84 
 
 		 380 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  72.33 
 
 		 367 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  71.78 
 
 		 368 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  74.59 
 
 		 372 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  74.86 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  64.19 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 371 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  60.82 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.73 
 
 		 373 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  59.89 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  59.84 
 
 		 369 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  58.9 
 
 		 369 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  59.45 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  61.98 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.08 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.08 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  58.08 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.08 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.08 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  61.31 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  57.81 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.81 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  60.38 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  58.13 
 
 		 366 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  59.4 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  58.68 
 
 		 374 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  59.72 
 
 		 364 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  58.76 
 
 		 371 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  58.79 
 
 		 370 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  62.57 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 		 364 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  61.64 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  61.43 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  59.44 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  56.94 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  55.71 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  54.82 
 
 		 370 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  55.62 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  52.34 
 
 		 374 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  53.69 
 
 		 372 aa  345  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  49.73 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  51.1 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  46.17 
 
 		 383 aa  341  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  48.91 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  48.48 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  47.96 
 
 		 363 aa  315  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.45 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  41.87 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  38.4 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  29.35 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  32.61 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  28.96 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  32.13 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  28.96 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  32.2 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  30.15 
 
 		 397 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  37.04 
 
 		 625 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  31.49 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  30.86 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  31.29 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 442 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.46 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 500 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  30.79 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  33.09 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  28.65 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  28.57 
 
 		 473 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  26.81 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  29.28 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.29 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>