More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0411 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 		 473 aa  933    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 		 485 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  47.13 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  46.95 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  43.76 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  45 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 965 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.49 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  43.76 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  43.76 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 478 aa  363  4e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 480 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 		 491 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  36.63 
 
 		 508 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.97 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 470 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 465 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  33.68 
 
 		 387 aa  196  1e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  30.83 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  41.45 
 
 		 698 aa  157  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.4 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 374 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.88 
 
 		 373 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 373 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.88 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.88 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.88 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.88 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 369 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 366 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 362 aa  136  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 364 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.57 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.48 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  25.71 
 
 		 437 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 368 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  25.33 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  29.89 
 
 		 625 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  31.96 
 
 		 407 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 364 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 364 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  26.18 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  25.6 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  28.62 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  28.62 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.62 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 409 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>