250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2610 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 364 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  96.7 
 
 		 364 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  85.44 
 
 		 366 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  71.15 
 
 		 364 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  70.05 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  68.19 
 
 		 365 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.17 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.61 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  58.95 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  59.23 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.17 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.17 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.17 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  59.56 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.17 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  59.83 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  59.5 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  59.5 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  59.5 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  59.17 
 
 		 373 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  59.17 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  57.94 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  56.67 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  59.72 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  58.22 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  58.89 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  58.22 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  57.85 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  59.08 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  56.35 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  57.76 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.23 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  58.62 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  55.15 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  56.4 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  59.15 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  55.98 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  57.67 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  53.61 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  48.26 
 
 		 378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  54.87 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  52.25 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  53.42 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  54.65 
 
 		 370 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  52.57 
 
 		 376 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  51.52 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  46.58 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  50.28 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  49.7 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.63 
 
 		 378 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  44.78 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  42.78 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  36.46 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 447 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  32.74 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  32.25 
 
 		 625 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  29.17 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.25 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  35.53 
 
 		 408 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  33.5 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  32.44 
 
 		 511 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 407 aa  139  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  29.3 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  29.53 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.83 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  34.65 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  35.56 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 476 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 412 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  35.56 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 493 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.36 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  29.03 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 496 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  29.5 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  26.03 
 
 		 473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>