More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0628 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  52.22 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 368 aa  352  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  52.33 
 
 		 372 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  48.63 
 
 		 374 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  50.29 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  50.96 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.17 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.17 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.17 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  49.17 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  48.34 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  51.29 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.61 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.06 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  45.8 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  48.25 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  52.15 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  50.86 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 369 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 369 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 369 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.99 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  47.06 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  46.67 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 		 370 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.38 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  46.18 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  44.74 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  45.55 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  44.78 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  44.25 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 363 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  36.62 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  37.78 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  36.12 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  34.15 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  28.01 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.96 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  34.68 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.17 
 
 		 503 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.83 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  30.33 
 
 		 427 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  28.71 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  30.34 
 
 		 511 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  36.7 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  30.88 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  30.69 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  30.69 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 500 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 496 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  33.01 
 
 		 625 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 965 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.9 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>