234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2799 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
380 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  61.5 
 
 
368 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 
371 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  60.93 
 
 
367 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  62.23 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  59.34 
 
 
368 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  57.81 
 
 
367 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  59.02 
 
 
368 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 
380 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  56.2 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  61.22 
 
 
372 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  59.83 
 
 
367 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  58.29 
 
 
369 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  57.46 
 
 
369 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  60.61 
 
 
367 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  57.1 
 
 
369 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  56.23 
 
 
370 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  55.77 
 
 
374 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
369 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
369 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
369 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  57.3 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  57.3 
 
 
368 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  57.1 
 
 
366 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  55.41 
 
 
373 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.58 
 
 
368 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  56.32 
 
 
371 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  59.13 
 
 
366 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.32 
 
 
373 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  56.98 
 
 
364 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  57.46 
 
 
364 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  56.23 
 
 
370 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.85 
 
 
371 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  58.02 
 
 
371 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 
366 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  54.5 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  52.75 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
378 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 
364 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  55.35 
 
 
373 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 
364 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  53.48 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 
371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  52.07 
 
 
369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 
374 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 
375 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  52.46 
 
 
365 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  52.06 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  48.9 
 
 
368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  49.32 
 
 
368 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  43.5 
 
 
383 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.71 
 
 
378 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  48.52 
 
 
363 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  39.52 
 
 
373 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
362 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  37.59 
 
 
447 aa  210  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  39.14 
 
 
406 aa  210  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  31.74 
 
 
427 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
409 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  33.5 
 
 
398 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  31.67 
 
 
427 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
479 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  29.22 
 
 
625 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  29.24 
 
 
404 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.52 
 
 
476 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  29.7 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  30.69 
 
 
397 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  29.75 
 
 
409 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.87 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  29.44 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  30.05 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  30.25 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
476 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  30.54 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
406 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  31.49 
 
 
396 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  29.44 
 
 
410 aa  133  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
496 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  28.72 
 
 
425 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  29.63 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  29.63 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.34 
 
 
404 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
485 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>