More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2959 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  91.18 
 
 		 366 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  89.7 
 
 		 369 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 369 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  98.92 
 
 		 369 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  89.7 
 
 		 369 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  91.28 
 
 		 369 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  89.7 
 
 		 369 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  80.98 
 
 		 373 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  78.8 
 
 		 373 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  78.8 
 
 		 373 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  78.8 
 
 		 373 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  78.8 
 
 		 373 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  79.08 
 
 		 373 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  78.53 
 
 		 373 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  78.53 
 
 		 373 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  72.36 
 
 		 368 aa  524  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  72.09 
 
 		 368 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  71.54 
 
 		 368 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  60.88 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 		 368 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  58.15 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  60.61 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  59.89 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  62.71 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  59.62 
 
 		 368 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  60.33 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  58.76 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  57.73 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  59.45 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  58.1 
 
 		 364 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  59.94 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  57.54 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  58.29 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  60.33 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  62.1 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  57.85 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  57.53 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  51.08 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  58.56 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.26 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  59.23 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  58.08 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  55.52 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  57.5 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  55.49 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  54.67 
 
 		 368 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  56.18 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  52.21 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  48.41 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  54.25 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  54.71 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 		 371 aa  328  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 374 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  44.68 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.39 
 
 		 378 aa  292  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  36.62 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 500 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 403 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 496 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  29.59 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  30.15 
 
 		 396 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  36.92 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  36.92 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  37.59 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  36.92 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  36.56 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.08 
 
 		 503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  31.44 
 
 		 625 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  30.52 
 
 		 398 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  35.27 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.99 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  32 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  30.99 
 
 		 511 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  30.71 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.43 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>