223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1660 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  100 
 
 		 625 aa  1261    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  75.57 
 
 		 401 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  65.61 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  56.81 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  54.66 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  53.85 
 
 		 427 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  54.52 
 
 		 396 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  55.44 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  54.23 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  51.32 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  54.26 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  50.91 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  51.76 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 		 398 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  50.27 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  44.39 
 
 		 409 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 		 399 aa  359  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  49.1 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  43.3 
 
 		 402 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  44.39 
 
 		 410 aa  357  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 395 aa  354  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 442 aa  353  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  42.78 
 
 		 402 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  44.14 
 
 		 410 aa  352  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  45.08 
 
 		 403 aa  350  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 397 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  43.64 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  46.55 
 
 		 398 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.68 
 
 		 396 aa  340  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 		 400 aa  339  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 		 407 aa  337  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  42.23 
 
 		 397 aa  336  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  46.31 
 
 		 394 aa  334  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  42.02 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  42.6 
 
 		 404 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  46.84 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  42.31 
 
 		 398 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  41.55 
 
 		 399 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  39.39 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  43.19 
 
 		 425 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  39.73 
 
 		 400 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  42.41 
 
 		 416 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  42.41 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  42.23 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  42.23 
 
 		 396 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  42.15 
 
 		 416 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  41.75 
 
 		 396 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  40.53 
 
 		 408 aa  308  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  40.53 
 
 		 410 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  40.63 
 
 		 403 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  37.47 
 
 		 416 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  39.84 
 
 		 422 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 422 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  39.58 
 
 		 422 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  39.58 
 
 		 422 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  39.58 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  39.84 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  39.32 
 
 		 422 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  39.32 
 
 		 422 aa  280  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  39.32 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  38.92 
 
 		 422 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  38.66 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  38.66 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  38.96 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  38.66 
 
 		 422 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 400 aa  259  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 399 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 399 aa  209  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.19 
 
 		 403 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.26 
 
 		 409 aa  200  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  43.78 
 
 		 245 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 		 367 aa  173  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 367 aa  161  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 364 aa  158  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 367 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 367 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 371 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  34.41 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.1 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.42 
 
 		 373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.42 
 
 		 373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.42 
 
 		 373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.42 
 
 		 373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 373 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.42 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.48 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 371 aa  150  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 369 aa  150  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 366 aa  150  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 362 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  37 
 
 		 373 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>