256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2833 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  96.7 
 
 		 364 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 364 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  86.26 
 
 		 366 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  72.25 
 
 		 364 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  70.6 
 
 		 364 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  69.05 
 
 		 365 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.72 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  60.94 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  60.22 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.44 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.44 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.44 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  59.44 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.44 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.44 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  61.11 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  59.44 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  57.77 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  60.56 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 371 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  57.94 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  55.12 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  55.12 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  58.72 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  58.91 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  55.77 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  58.38 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  59.65 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  56.27 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  57.56 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.14 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  55.22 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  59.48 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  60.63 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  58.52 
 
 		 372 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 		 378 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  54.64 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  56.7 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  52.81 
 
 		 372 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  54.02 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  53.87 
 
 		 370 aa  335  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  52.85 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  48.16 
 
 		 383 aa  332  7.000000000000001e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  51.79 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 375 aa  311  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  50.83 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  50.3 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.65 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  43.32 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  35.92 
 
 		 406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 		 447 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  34.67 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  33.25 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  33.24 
 
 		 511 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  31.5 
 
 		 625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.25 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  29.17 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  36.22 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  29.78 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 496 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  30.12 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.83 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  29.75 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  35.93 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 485 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  26.88 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  29.81 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>