More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3598 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 399 aa  825    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  72.28 
 
 		 398 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  54.18 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  54.48 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  54.48 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  54.18 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  53.4 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  50.89 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.52 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  49.62 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  46.94 
 
 		 625 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  45.82 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  45.57 
 
 		 409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  44.19 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  43.77 
 
 		 403 aa  358  9e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  43 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  47.24 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  47.38 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  45.06 
 
 		 422 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  41.77 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  45.06 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  45.06 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  45.06 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  45.06 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 		 410 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  45.32 
 
 		 422 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  45.06 
 
 		 422 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.98 
 
 		 396 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 403 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  43.72 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  46.21 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  44.08 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  44.05 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 		 410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.95 
 
 		 390 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  45.96 
 
 		 416 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  42.78 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  45.96 
 
 		 416 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 401 aa  338  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  42.03 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  43.19 
 
 		 398 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 406 aa  335  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  44.11 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  44.51 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 412 aa  332  5e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  41.96 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  42.07 
 
 		 410 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  44.32 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  42.53 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  42.53 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  42.53 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  42.42 
 
 		 396 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  40.3 
 
 		 416 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  41.9 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  43.82 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  41.08 
 
 		 402 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  33.42 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.66 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  41.95 
 
 		 245 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.41 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  26.93 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.56 
 
 		 368 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.15 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.28 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.28 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  28.12 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.28 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.28 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.28 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>