More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5628 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
398 aa  818    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  72.28 
 
 
399 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  55.08 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  55.08 
 
 
402 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  53.3 
 
 
404 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  53.05 
 
 
407 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  53.28 
 
 
404 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  51.13 
 
 
400 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  48.74 
 
 
409 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.13 
 
 
399 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  49.61 
 
 
400 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  48.6 
 
 
625 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 
401 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 
394 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  45.8 
 
 
397 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  45.29 
 
 
397 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  44.92 
 
 
398 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  43.72 
 
 
427 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  44.5 
 
 
398 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  43.62 
 
 
398 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  46.34 
 
 
400 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  47.07 
 
 
403 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  44.9 
 
 
403 aa  348  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  43.77 
 
 
409 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47 
 
 
396 aa  346  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  44.88 
 
 
416 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.23 
 
 
390 aa  345  7e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  44.97 
 
 
396 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  45.14 
 
 
416 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  45.14 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  42.71 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  42.03 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  46.44 
 
 
395 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  45.23 
 
 
406 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  45.23 
 
 
396 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  42 
 
 
427 aa  338  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  43.23 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  45.09 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  44.84 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  44.84 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  44.84 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  42.35 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  43 
 
 
410 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  44.58 
 
 
422 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  44.56 
 
 
422 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 
442 aa  336  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  42.71 
 
 
408 aa  336  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  44.56 
 
 
422 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  42.57 
 
 
412 aa  335  7e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 
422 aa  335  9e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  44.69 
 
 
408 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  43.23 
 
 
425 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  44.3 
 
 
422 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  44.3 
 
 
422 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 
422 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 
422 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  42.45 
 
 
410 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  43 
 
 
410 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  43.8 
 
 
422 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  43.3 
 
 
396 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  41.65 
 
 
416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  44.2 
 
 
399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 
400 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  40.9 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
400 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  43.4 
 
 
245 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 
399 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 
399 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
406 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  32.59 
 
 
409 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.8 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.6 
 
 
373 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
405 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
374 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.35 
 
 
373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.35 
 
 
373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
373 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.35 
 
 
373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.35 
 
 
373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.1 
 
 
373 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
373 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
375 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  27.83 
 
 
373 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
476 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
367 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.27 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  28.98 
 
 
383 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
369 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.46 
 
 
476 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
369 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
369 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
369 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>