More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1428 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 368 aa  735    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  91.01 
 
 		 380 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  82.47 
 
 		 366 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  75.34 
 
 		 367 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  73.42 
 
 		 368 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  77.26 
 
 		 372 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  76.71 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  65.01 
 
 		 367 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  62.23 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.82 
 
 		 373 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.55 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.55 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.55 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  61.1 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.55 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  61.2 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  59.35 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  59.62 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.27 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  61.37 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  61.37 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  61.37 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  60.27 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  62.84 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  61.81 
 
 		 368 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  61.64 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  62.19 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  60.33 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  61.64 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  55.44 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  59.23 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  60.55 
 
 		 368 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  60.94 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  59.73 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  58.08 
 
 		 364 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  63.19 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  59.94 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  61.58 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  61.31 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  58.82 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  57.97 
 
 		 370 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  55.59 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  57.1 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  59.17 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  55.36 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  55.11 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  54.42 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  52.76 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 		 374 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  51.81 
 
 		 371 aa  345  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  49.59 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  44.97 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.62 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  50.55 
 
 		 368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  48.5 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  43.35 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  36.97 
 
 		 406 aa  209  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 		 447 aa  182  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  33.25 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  33.01 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  31.28 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  33.09 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  31.28 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  31.5 
 
 		 625 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  32.62 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  32.46 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  30.08 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  34.42 
 
 		 396 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.59 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  30.4 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 403 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  28.57 
 
 		 473 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.79 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  29.15 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.8 
 
 		 503 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  29.67 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  29.34 
 
 		 404 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  31.95 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  27.86 
 
 		 407 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  27.39 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>