More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2648 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  54.16 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  54.99 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  54.01 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  54.2 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  53.58 
 
 		 373 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  53.1 
 
 		 369 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  55.38 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  52.63 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  53.78 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  56.45 
 
 		 366 aa  346  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  52.83 
 
 		 366 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  52.46 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.79 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.79 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.79 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.79 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  52.79 
 
 		 373 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  47.7 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.79 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  52.79 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  52.7 
 
 		 368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 380 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  52.85 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  52.57 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  53.28 
 
 		 371 aa  325  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  52.59 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  52.45 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  51.36 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 364 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  49.05 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  50.42 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  51.53 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  49.73 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 		 371 aa  295  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  43.23 
 
 		 383 aa  292  7e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  49.86 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  48.66 
 
 		 368 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  40.74 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  38.9 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  38.99 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 		 447 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  33.33 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  33.33 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  31.99 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  38.99 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  31.93 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  29.1 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  31.93 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  32.7 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  32.35 
 
 		 625 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  39.62 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  29.81 
 
 		 402 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  35.44 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 407 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  29.54 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  37.05 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 442 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  37.05 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.99 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  35.51 
 
 		 408 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  30.24 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  32.66 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 496 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  32.94 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.5 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  34.65 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>