More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1107 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  100 
 
 		 404 aa  837    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  83.42 
 
 		 407 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  75.89 
 
 		 402 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  75.89 
 
 		 402 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  70.9 
 
 		 404 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  63.96 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  51.74 
 
 		 409 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  54.31 
 
 		 396 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  52.76 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  53.4 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.66 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.27 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  48.35 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  47.85 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  47.31 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  46.84 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  46.91 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  47.7 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  47.22 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  46.15 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  46.37 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  46.62 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  45.13 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  47.33 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  46.37 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  46.37 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  45.78 
 
 		 410 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  45.13 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  46.82 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  45.96 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 		 422 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  46.82 
 
 		 422 aa  362  9e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  46.82 
 
 		 422 aa  362  9e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  46.82 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  47.07 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  46.82 
 
 		 422 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  46.82 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  45.78 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  47.07 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  46.08 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  46.31 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  47.07 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  47.07 
 
 		 422 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  46.82 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  43.62 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  44.61 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  45.23 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  43.64 
 
 		 625 aa  345  8e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  40.52 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  44.27 
 
 		 406 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  40 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  39.57 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  43.67 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  41.39 
 
 		 412 aa  315  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  45.92 
 
 		 400 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  40.77 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 442 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  40.6 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  45 
 
 		 245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.94 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.99 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 405 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  30.71 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.6 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.95 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.97 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>