132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  75.1 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  72.54 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  66.53 
 
 		 398 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  65.02 
 
 		 397 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  65.15 
 
 		 409 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  63.9 
 
 		 410 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  61.16 
 
 		 403 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  63.49 
 
 		 410 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  57.09 
 
 		 403 aa  298  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  56.91 
 
 		 416 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  57.56 
 
 		 400 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  56.85 
 
 		 399 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  56.9 
 
 		 407 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  56.38 
 
 		 416 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  56.38 
 
 		 416 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  55.97 
 
 		 416 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  53.25 
 
 		 410 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  56.43 
 
 		 422 aa  272  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  56.02 
 
 		 422 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  56.43 
 
 		 422 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  56.02 
 
 		 422 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  52.85 
 
 		 408 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  56.02 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  55.6 
 
 		 422 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  55.6 
 
 		 422 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  55.6 
 
 		 422 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  55.6 
 
 		 422 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  55.83 
 
 		 425 aa  267  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  54.77 
 
 		 422 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  54.36 
 
 		 422 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  54.77 
 
 		 422 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  54.36 
 
 		 422 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  54.36 
 
 		 422 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  47.08 
 
 		 400 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  48.33 
 
 		 396 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  48.33 
 
 		 406 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  48.33 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  48.51 
 
 		 404 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  44.96 
 
 		 402 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  43.27 
 
 		 407 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  44.54 
 
 		 402 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  45 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.23 
 
 		 399 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 394 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.23 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  44.68 
 
 		 398 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  46.64 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 		 401 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 398 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  43.7 
 
 		 409 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 		 403 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 400 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  43.78 
 
 		 625 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.26 
 
 		 396 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  43.15 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 399 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 442 aa  191  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 		 396 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  42.37 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  42.42 
 
 		 396 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 		 406 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 400 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  44.22 
 
 		 427 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  43.08 
 
 		 427 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 399 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 412 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  36.71 
 
 		 400 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 437 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 399 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 399 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 405 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 406 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 405 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.99 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.32 
 
 		 403 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 494 aa  62.4  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  26.07 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.93 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  24.69 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 447 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 463 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 478 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 496 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  24.43 
 
 		 406 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 479 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  31.25 
 
 		 373 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  23.72 
 
 		 448 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 367 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.88 
 
 		 366 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 479 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 500 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>