More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2590 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 400 aa  814    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  42.13 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  41.12 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  41.37 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  43.29 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  40.1 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  38.74 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  39.38 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.12 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  40.1 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.36 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  39.35 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  39.49 
 
 		 406 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.72 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  39.55 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  38.64 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  38.06 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  39.55 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  36.65 
 
 		 399 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  39.14 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  38.83 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  39.09 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  39.12 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  39.38 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  39.38 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  41.53 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  36.68 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  40.36 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  37.75 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  37.14 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  36.25 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  35.48 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  38.87 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  38.87 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  38.87 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  38.87 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  38.34 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  38.79 
 
 		 398 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  38.61 
 
 		 422 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  38.01 
 
 		 422 aa  262  8e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  37.18 
 
 		 625 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  38.01 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  38.01 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  38.01 
 
 		 422 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  38.01 
 
 		 422 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  38.01 
 
 		 422 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  37.74 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  37.74 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  36.53 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  34.7 
 
 		 416 aa  256  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  39.65 
 
 		 406 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  38.02 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.18 
 
 		 409 aa  245  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  36.63 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  36.99 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  41.22 
 
 		 245 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 362 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 496 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  28.64 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  28.33 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.53 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.37 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.61 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.51 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.51 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.51 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.51 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.27 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>