More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41947 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  100 
 
 		 383 aa  796    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 		 378 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  47.11 
 
 		 367 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.81 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  46.48 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  48.68 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  48.94 
 
 		 369 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  48.4 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 369 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  48.29 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.75 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.75 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  48.53 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  46.61 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  47.75 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  47.49 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  45.91 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.75 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.75 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 371 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.48 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  47.48 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  49.16 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  45.69 
 
 		 371 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  47.24 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  43.65 
 
 		 368 aa  325  9e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.23 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  47.8 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  45.38 
 
 		 368 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  48.16 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  45.79 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.56 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  44.91 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  46.58 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  44.97 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  43.83 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  44.13 
 
 		 373 aa  292  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  46.44 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  43.17 
 
 		 365 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  43.08 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  40.36 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  39.03 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  37.7 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 		 447 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 394 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  31.02 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  31.14 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  34.41 
 
 		 625 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  30.41 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  30.47 
 
 		 406 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  29.9 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.61 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  29.86 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  30.1 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  28.5 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  30.71 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  27.74 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  27.01 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  28.43 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  32.13 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  27.91 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  32.97 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  29.89 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  27.03 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  26.61 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>