274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0530 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  760    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  55.2 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  53.76 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  54.3 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  51.63 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  51.08 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  51.08 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  50.4 
 
 		 368 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  49.32 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  51.73 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  46.61 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  51.22 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  49.59 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  50.41 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  50.41 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  50.41 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  50.41 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 369 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  51.34 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  50.14 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 		 378 aa  328  8e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  51.09 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  47.96 
 
 		 374 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  49.57 
 
 		 372 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 		 368 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  50.73 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.88 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  50.55 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  49.73 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  49.28 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  51.62 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  47.72 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  46.24 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  45.38 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  45.41 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  43.7 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  45.53 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  41.58 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  38.38 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  29.56 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  30 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  29.17 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  30.81 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  30.68 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  29.03 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  29.93 
 
 		 625 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  29.17 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.36 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 496 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  30.24 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  30.3 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  30.47 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  28.29 
 
 		 404 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  31.9 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  25.32 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  29.06 
 
 		 403 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 500 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.29 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  30.79 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.2 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  25.13 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>