More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2365 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 409 aa  835    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  53.59 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  53.85 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  51.74 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  51.74 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 407 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  51.41 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  54.03 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  50.91 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  50.75 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 403 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  48.19 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  48.05 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  47.24 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  50.26 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  50.79 
 
 		 408 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  47.34 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  47.8 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  45.18 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  47.8 
 
 		 396 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  47.8 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  45.88 
 
 		 403 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  49.08 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  45.13 
 
 		 409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  45.13 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 395 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  44.56 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.54 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  43.81 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  43.32 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  45.38 
 
 		 410 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  43.56 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  45.78 
 
 		 422 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  45.27 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  45.27 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  45.38 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  45.36 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  45.27 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  45.27 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  45.52 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  47.89 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  45.36 
 
 		 416 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  45.27 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  45.27 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  44.22 
 
 		 416 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  43.43 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  44.76 
 
 		 422 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  44.76 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  44.76 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  44.76 
 
 		 422 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  44.76 
 
 		 422 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  45.96 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  42.71 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  44.07 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  41.48 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  40.87 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.95 
 
 		 403 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  43.7 
 
 		 245 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 399 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  33.22 
 
 		 494 aa  169  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  30.49 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  29.53 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  28.54 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 496 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.68 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.78 
 
 		 503 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>