More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2022 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  97.74 
 
 		 399 aa  770    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 399 aa  815    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.27 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  56.01 
 
 		 408 aa  444  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.43 
 
 		 403 aa  308  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  43.81 
 
 		 406 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  37.76 
 
 		 625 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  37.35 
 
 		 427 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 412 aa  216  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  34.78 
 
 		 404 aa  212  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  34.45 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  34.6 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  32.49 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  37.57 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  33.84 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  36.9 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  36.55 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  31.79 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  34.41 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  33.7 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.16 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  34.68 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  35.01 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  35.01 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  32.75 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  33.58 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  33.16 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  33.07 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.83 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  32.75 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  32.75 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  36.94 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  32.75 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.64 
 
 		 396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  31.23 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  32.69 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  31.76 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  30.41 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  29.86 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  30.68 
 
 		 416 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  31.76 
 
 		 408 aa  176  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  28.88 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  31.22 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  29.43 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  29.7 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  29.7 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  29.43 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  29.43 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  29.43 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  29.43 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  29.43 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  29.18 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  29.95 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  29.95 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  29.68 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  29.95 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  29.95 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  29.56 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.62 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  30.25 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 364 aa  123  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>